| 3ª Etapa | km: 9.7 | ||||
| 1º | 5 | NOZAL, Isidro | ESP | Once - Eroski | 25 |
| 2º | 4 | HRUSKA, Jan | CZE | Once - Eroski | 20 |
| 3º | 44 | MILLAR, David | GBR | Cofidis | 16 |
| 4º | 71 | BOTERO, Santiago | COL | Kelme - Costa Blanca | 14 |
| 5º | 38 | TETERIOUK, Andre | KZA | CCC Polsat | 12 |
| 6º | 143 | CAMAÑO, Iker | ESP | Phonak Hearing Systems | 10 |
| 7º | 1 | OLANO, Abraham | ESP | Once - Eroski | 9 |
| 8º | 77 | TAULER, Antonio | ESP | Kelme - Costa Blanca | 8 |
| 9º | 8 | ZARRABEITIA, Mikel | ESP | Once - Eroski | 7 |
| 10º | 55 | MARTINEZ, Alberto | ESP | Euskaltel - Euskadi | 6 |
| 11º | 154 | GARRIDO, Martín | ARG | Relax - Fuenlabrada | 5 |
| 12º | 47 | MONCOUTIE, David | FRA | Cofidis | 4 |
| 13º | 58 | ZUBELDIA, Haimar | ESP | Euskaltel - Euskadi | 3 |
| 14º | 88 | ZINTCHENKO, Andrei | RUS | LA - Pecol | 2 |
| 15º | 17 | GONZALEZ, Santos | ESP | Acqua & Sapone | 1 |