| 3ª Etapa | km: 13,2 | ||||
| 1º | 44 | HRUSKA, Jan | CZE | ONCE - Eroski | 25 |
| 2º | 46 | OLANO, Abraham | ESP | ONCE - Eroski | 20 |
| 3º | 1 | DOMINGUEZ, Juan Carlos | ESP | IBanesto.com | 16 |
| 4º | 42 | AZEVEDO, José | POR | ONCE - Eroski | 14 |
| 5º | 53 | CASTANHEIRA Bruno | POR | L.A. - Pecol | 12 |
| 6º | 123 | CUESTA, Iñigo | ESP | Cofidis | 10 |
| 7º | 97 | VAZQUEZ, J.Manuel | ESP | Colchon Relax - Fuenlabrada | 9 |
| 8º | 154 | GUTIERREZ, José | ESP | Kelme - Costa Blanca | 8 |
| 9º | 74 | TOTSCHNIG, Georg | AUT | Team Gerolsteiner | 7 |
| 10º | 118 | MARTINEZ, Alberto | ESP | Euskaltel - Euskadi | 6 |
| 11º | 41 | ANDRLE, Rene | CZE | ONCE - Eroski | 5 |
| 12º | 112 | ETXEBARRIA, Unai | VEN | Euskaltel - Euskadi | 4 |
| 13º | 6 | ODRIOZOLA, Jon | ESP | IBanesto.com | 3 |
| 14º | 93 | FERNANDEZ, David | ESP | Colchon Relax - Fuenlabrada | 2 |
| 15º | 145 | MARTIN PERDIGUERO, M.A. | ESP | Cantina Tollo Acqua & Sapone | 1 |